Isar se encuentra muy cerca de la ciudad de Burgos, desde donde se puede llegar saliendo en dirección a León por la autovía A-231. En la salida de Villanueva de Argaño, se toma la carretera BU-406 en dirección sur, y a 2 kilómetros se encuentra Isar (se encuentra adecuadamente señalizado).
También se puede acceder desde la autovía A-62, tomando la salida de Estépar y circulando 10 kilómetros por la carretera BU-406 en dirección norte (siguiendo la señalización hacia Villanueva de Argaño).